Управление Агентства по надзору в сфере образования и науки при Президенте Республики Таджикистан в городе Душанбе как структурное подразделение Агентства по надзору в сфере образования и науки при Президенте Республики Таджикистан было основано согласно указу Президента Республики Таджикистан от 18 июня 2020 года, № 1557.